V rámci systému poručníctva Organizácie Spojených národov vytvoreného po druhej svetovej vojne mali Francúzi povinnosť posunúť Togo k samospráve. Miestna vlajka bola prijatá v roku 1956, krátko pred tým, ako sa krajina stala samostatnou republikou v rámci Francúzskej únie. Zelené pozadie vlajky predstavuje poľnohospodárstvo, nádej a mládež; francúzsky trikolor v hornom rohu výťahu bol pripomienkou francúzskej nadvlády. Dve žlté päťcípé hviezdy usporiadané na pomyselnej diagonálnej línii vedenej od dolného výťahu po hornú mušku odkazovali na pobrežné nížiny na juhu a savany na severe, „zjednotené v láske k poriadku a práci“.
27. apríla 1960 sa Togo osamostatnilo pod úplne novou vlajkou; zmenila dve hviezdy na jednu, aby zdôraznila národnú jednotu. Päť zelených a žltých pruhov vlajky zodpovedá administratívnym regiónom krajiny, zatiaľ čo tieto farby pripomínajú, že drvivá väčšina obyvateľstva závisí od krajiny, v ktorej sa nachádza (zelená), a od vlastnej pracovnej sily pre rozvoj (žltá). Hovorí sa, že červený kantón stojí za láskou, vernosťou a láskou, zatiaľ čo biela hviezda je spojená s čistotou. Rovnaké panafrické červeno-žltozelené farby vybralo niekoľko ďalších krajín, ktoré získali nezávislosť krátko pred alebo po Togu.
