Roderick MacKinnon, (narodený 19. februára 1956, Burlington, Massachusetts, USA), americký lekár, hlavný nositeľ Nobelovej ceny za chémiu v roku 2003 za jeho priekopnícky výskum iónových kanálov v bunkových membránach. Cenu zdieľal s Peterom Agre, tiež zo Spojených štátov.
MacKinnon získal titul MD na Tufts University School of Medicine v roku 1982. Po niekoľkých rokoch praktickej medicíny sa začal venovať základnému výskumu, ktorý začal v roku 1986 postdoktorandskou prácou na iónových kanáloch na Brandeis University. V roku 1989 nastúpil na Harvardskú univerzitu av roku 1996 sa presťahoval na Rockefellerovu univerzitu ako profesor a vedúci laboratória. O rok neskôr bol vymenovaný za vyšetrovateľa v lekárskom ústave Howarda Hughesa v Rockefellerovej.
Obzvlášť dôležité pre nervový systém a srdce sú iónové kanály špecializované otvory v bunkových membránach, ktoré umožňujú iónom, ako je draslík a sodík, ľahko prúdiť dovnútra a von z buniek; podobné štruktúry existujú aj na priechod vody. Priekopnícka práca spoločnosti MacKinnon sa zamerala na „filtre“ v kanáloch, ktoré prešli jedným typom iónov, zatiaľ čo ostatné blokujú. Aby pochopil, ako tieto filtre fungujú, získal röntgenovou difrakciou ostrejšie obrazy kanálov. V roku 1998 určil trojrozmernú molekulárnu štruktúru iónového kanála. MacKinnon objavil kanál, ktorého architektúra má takú veľkosť, ktorá ľahko stripuje ióny draslíka - ale nie sodíka - ich pridružených molekúl vody a umožňuje im ich prekĺznuť. Na konci kanála najbližšie k vnútrajšku bunky tiež našiel molekulárny „senzor“, ktorý reaguje na podmienky okolo bunky a vysiela signály, ktoré kanál otvárajú a zatvárajú vo vhodných časoch. Jeho priekopnícka práca umožnila vedcom sledovať vývoj liekov na choroby, pri ktorých hrajú úlohu iónové kanály.
