Vaječník, v botanike, zväčšená bazálna časť pestíku, ženský orgán kvetu. Vaječník obsahuje vajíčka, ktoré sa po oplodnení vyvíjajú na semená. Samotný vaječník dozrie na ovocie, suché alebo mäsité, obklopujúce semená.
Jednoduchý alebo jednokomorový vaječník je tvorený jedným karpolom, evolučne modifikovaným listom. Má jednu lokus (komoru), v ktorej sú vajíčka. Multikarpelátový vaječník pozostáva z viac ako jedného karpelu a môže mať jeden alebo viac lokusov.
Pozícia vaječníkov je užitočným znakom pri klasifikácii. Vaječník pripevnený nad inými kvetinovými časťami sa označuje ako vynikajúci (pozri fotografiu); ak leží pod pripevnením iných kvetinových častí, je nižšia (pozri fotografiu).
