John Howard Northrop (narodený 5. júla 1891, Yonkers, NY, USA) zomrel 27. mája 1987, Wickenberg, Ariz.), Americký biochemik, ktorý (spolu s Jamesom B. Sumnerom a Wendell M. Stanley) získal Nobelovu cenu za chémiu v 1946 pre úspešné čistenie a kryštalizáciu určitých enzýmov, čo mu umožňuje určiť ich chemickú povahu.
Northrop bol vzdelaný na Columbia University, kde v roku 1915 získal doktorát chémie. V prvej svetovej vojne bol kapitánom americkej armády pre chemické bojové služby.
Počas prvej svetovej vojny Northrop uskutočnil výskum fermentačných procesov vhodných na priemyselnú výrobu acetónu a etylalkoholu. Táto práca viedla k štúdiu enzýmov nevyhnutných pre trávenie, dýchanie a všeobecné životné procesy. V tom čase nebola známa chemická povaha enzýmov, ale prostredníctvom svojho výskumu Northrop dokázal dokázať, že enzýmy dodržiavajú zákony chemických reakcií. Kryštalizoval pepsín, tráviaci enzým prítomný v žalúdočnej šťave, v roku 1930 a zistil, že je to proteín, čím sa vyriešil spor o tom, aké enzýmy sú. Rovnakými chemickými metódami izoloval v roku 1938 prvý bakteriálny vírus (bakteriofág), ktorý sa ukázal ako nukleoproteín. Northrop tiež pomohol izolovať a pripraviť v kryštalickej forme neaktívny prekurzor pepsínu pepsínu (ktorý sa premieňa na aktívny enzým reakciou s kyselinou chlorovodíkovou v žalúdku); tráviace enzýmy pankreasu trypsín a chymotrypsín; a ich neaktívne prekurzory trypsinogén a chymotrypsinogén.
Northrop bol najprv asistentom a potom členom Rockefellerovho inštitútu pre lekársky výskum v New Yorku od roku 1916 až do dôchodku v roku 1961, keď sa stal emeritným profesorom. Bol tiež hosťujúcim profesorom bakteriológie a biofyziky na Kalifornskej univerzite v Berkeley (1949 - 58). Jeho kniha Crystalline Enzymes (1939) bola dôležitým textom.