V roku 1954 bolo ako územie Holandských Antil založených šesť holandských závislostí Západnej Indie - Aruba, Bonaire, Curaçao, Saba, Svätý Martin (Sint Maarten) a Sint Eustatius, ktoré získali právo na samosprávu vo všetkých záležitostiach. okrem obrannej a zahraničnej politiky. Ostrovy tohto nového subjektu boli od 17. storočia výlučne pod holandskou štátnou vlajkou, a preto nemali žiadne tradičné miestne vlajky. Prvú vlajku Holandských Antíl vyhlásila holandská kráľovná Juliana 15. decembra 1959, ktorá znamenala piate výročie zákona, ktorým sa územie udeľuje autonómne.
Červenou, bielou a modrou vlajkou boli farby holandskej národnej vlajky, ktorá naďalej preletla nad ostrovmi. Biele hviezdy sa odvolávali na jednotlivé ostrovy. Pôvodne šesť, ich počet sa znížil na päť v roku 1986, keď sa Aruba oddelila od Holandských Antíl. Vlajka bola vyslaná 10. októbra 2010 po rozpustení Holandských Antíl na jej základné jednotky.
